Alligator Deep ist die tiefere äußere Seite des Alligator-Riffsystems, wo eine sekundäre Riffkante, ein Sandkanal und eine tiefere Blauwasserkante ein anspruchsvolleres Profil bieten als die einfacheren flachen Abschnitte in der Nähe. Der Tauchgang spricht Taucher an, die ein größeres Riffrelief, tieferes Wasser und eine bessere Chance auf vorbeiziehende Raubfische suchen, ohne dass der Ort zu einem reinen Wandtauchgang wird.