Banana Bay se trouve du côté est d'une île et possède un fond sablonneux avec une structure de récif corallien dur. La zone de la baie est peu profonde à modérée, avec un tombant abrupt accessible plus loin de la plage. Le récif abrite une variété de petits poissons de récif, et la baie peut occasionnellement recevoir des visiteurs pélagiques plus grands comme les raies manta et les requins baleines.