Ishigaki et Iriomote sont des bases voisines des Yaeyama, mais fonctionnent différemment. Ishigaki propose des plongées établies sur les récifs et à la rencontre des raies manta, du snorkeling encadré et des formations documentées d’apnée PADI/AIDA. À Iriomote, des opérateurs indépendants proposent des sorties en bateau pour plongeurs certifiés et des sorties de snorkeling à Barasu et Hatoma, ainsi que des expériences dans les mangroves protégées et près des cascades. Des ferries partent du port d’Ishigaki vers différentes côtes d’Iriomote ; la liaison vers Uehara est plus vulnérable aux vents du nord. L’observation des raies manta n’est jamais garantie, Ogan est réservé aux plongeurs dérivants expérimentés après sélection, et certains sites de l’intérieur d’Iriomote nécessitent une autorisation préalable de la municipalité. Privilégiez les sorties locales à la journée plutôt que de compter sur une croisière plongée non étayée, et prévoyez une marge en cas de changement de l’état de la mer.