Kefalonia est une île où l'on plonge avec des opérateurs locaux, pas une destination de croisière plongée. Les plongeurs planifient leurs sorties en bateau à la journée depuis Fiskardo, Skala, Lassi, Lixouri, Agia Efimia et les ports voisins, mêlant récifs aux eaux claires, cavernes, tombants, champs d'amphores et l'épave avancée du sous-marin HMS Perseus. Les personnes qui pratiquent le snorkeling profitent de criques turquoise faciles comme Emblissi, Foki, Antisamos, Koutsoupia, Spartia et Skala, tandis que les apnéistes peuvent trouver des baies calmes propices à l'entraînement, à condition de gérer le vent et la circulation des bateaux. Les non-plongeurs sont particulièrement bien servis : les grottes de Melissani et Drogarati, le parc national du mont Ainos, les vignobles Robola, Assos, Myrtos, l'observation des tortues à Argostoli et les restaurants des petits ports peuvent remplir tout un itinéraire. La principale saison aquatique s'étend de fin mai à octobre, septembre et début octobre offrant souvent le meilleur équilibre entre mer chaude, affluence modérée et bon accès aux opérateurs.