San Juan Reef est un récif de la partie nord de Cozumel, avec de grands coraux digités, du corail laitue, des zones sablonneuses et des éponges sur un profil en pente douce. C'est généralement un deuxième site de plongée pour les plongeurs dérivants expérimentés, avec des corniches et des surplombs qui abritent des gorettes, des schoolmasters, des demoiselles, et une forte action de requins et raies alimentée par le courant lorsque les conditions sont suffisamment calmes. Le récif récompense une bonne stabilisation, un contrôle soigné du groupe et une attention vigilante au mouvement de l'eau.